1、試劑儲存和準備區。貯存試劑和用于標本制備的消耗品等材料應當直接運送至試劑貯存和準備區，不能經過擴增檢測區，試劑盒中的陽性對照品及質控品不應當保存在該區，應當保存在標本制備區；
2、標本制備區。由于在樣本混合、核酸純化過程中可能會發生氣溶膠所致的污染，可通過在本區內設立正壓條件，避免從鄰近區進入本區的氣溶膠污染。為避免樣本間的交叉污染，加入待測核酸后，必須蓋好含反應混合液的反應管。對具有潛在危險性的材料，必須在生物安全柜內開蓋，并有明確的樣本處理和滅活程序；
3、擴增區。為避免氣溶膠所致的污染，應當盡量減少在本區內的走動。必須注意的是，所有經過檢測的反應管不得在此區域打開；
4、擴增產物分析區。本區是的擴增產物污染來源，因此必須注意避免通過本區的物品及工作服將擴增產物帶出。廢液及用過的吸頭必須收集至HCl中，不能在實驗室內傾倒，浸泡后再放到垃圾袋中按程序處理。由于本區有可能會用到某些可致基因突變和有毒物質如化乙錠、酰胺、甲醛或性核素等，故應當注意實驗人員的安全防護；
5、注意物品流向，依次為：試劑準備區、樣本制備區、擴增區、產物分析區，不可逆行；
6、試劑準備區、樣本制備區和擴增區內的實驗用品應，并設置不同的標識、顏色等予以區分。
PCR實驗室又叫基因擴增實驗室，實時熒光定量PCR技術是DNA定量技術的一次飛躍，是用于放大特定的DNA，可看作生物體外的特殊DNA。通過DNA基因系統，能迅速掌握患者體內的病毒含量，其度高達納米級別。
PCR檢測方法具有靈敏度高、特異性高、快捷、對樣品要求低等優點，因此被臨床醫生廣為認可，已廣泛應用于醫院的臨床診斷和各防疫檢測部門的禽疫病診斷。
在國家政策和疫情發展的推動下，各地區各級醫院都開始或者準備建立獨立合規的PCR實驗室，都已具備核酸檢測能力已經成為各機構。但由于各地區疫情的差異化使得長期低風險地區的一些核酸實驗室除了具備應急功能之外幾乎處于停滯狀態。此類情況也是各級醫院領導在建立實驗室擔心的問題，投入了資金和精力但又不能給醫院帶來創收。
根據實驗室的具體情況編寫質量體系文件，《質量手冊》、《程序文件》、《作業指導書》，并保證管理體系運行有效。
管理體系的特點是應有明確的目的、規范的管理、有效的制約、的機制、能自我發展的整體。
建立完善的SOP文件，對完成各項質量活動的方法作出規定，每個SOP都應對一個或一組相互關系的活動進行描述。
每個SOP文件應說明該項質量各環節的輸入、轉換和輸出所需的文件、物資、人員、記錄以及它們與有關活動的接口關系。
明確每個環節轉換過程中各項因素的要求，即由誰做、做什么、做到什么程序、達到什么要求，如何控制、形成什么記錄和報告，以及相應的審批手續。
規定在質量活動中需要注意的例外或特殊情況的糾正措施。SOP應簡練、明確和易懂并且工作人員熟練掌握和嚴格遵守。
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